MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidovorax sp. JS42 chromosome

Total Repeats: 116928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_008782	ACC	2	6	207153	207158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592624
6003	NC_008782	CAC	2	6	207167	207172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592624
6004	NC_008782	GCG	2	6	207238	207243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592624
6005	NC_008782	GCG	2	6	207281	207286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592624
6006	NC_008782	CGG	2	6	207346	207351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592624
6007	NC_008782	TGGC	2	8	207357	207364	0 %	25 %	50 %	25 %	121592624
6008	NC_008782	CAG	3	9	207374	207382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592624
6009	NC_008782	CCT	2	6	207418	207423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121592624
6010	NC_008782	CGG	3	9	207434	207442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592624
6011	NC_008782	CCA	2	6	207448	207453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592624
6012	NC_008782	GC	3	6	207539	207544	0 %	0 %	50 %	50 %	121592624
6013	NC_008782	GC	3	6	207572	207577	0 %	0 %	50 %	50 %	121592624
6014	NC_008782	GGC	2	6	207578	207583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592624
6015	NC_008782	CGG	2	6	207616	207621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592624
6016	NC_008782	CCT	2	6	207649	207654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121592624
6017	NC_008782	GCCAGC	2	12	207657	207668	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	121592624
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6021	NC_008782	CG	3	6	207775	207780	0 %	0 %	50 %	50 %	121592624
6022	NC_008782	CG	4	8	207818	207825	0 %	0 %	50 %	50 %	121592624
6023	NC_008782	CCA	2	6	207868	207873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592624
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6025	NC_008782	ATC	2	6	207911	207916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6034	NC_008782	CTG	2	6	208188	208193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592625
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6123	NC_008782	CG	3	6	210921	210926	0 %	0 %	50 %	50 %	121592628
6124	NC_008782	GCA	2	6	210929	210934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592628
6125	NC_008782	CGCA	2	8	211018	211025	25 %	0 %	25 %	50 %	121592628
6126	NC_008782	TCC	2	6	211027	211032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121592628
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6128	NC_008782	CGG	2	6	211076	211081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592628
6129	NC_008782	GGC	2	6	211094	211099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592628
6130	NC_008782	CAG	2	6	211104	211109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592628
6131	NC_008782	CCA	2	6	211118	211123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592628
6132	NC_008782	GCC	2	6	211182	211187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592628
6133	NC_008782	GCG	2	6	211223	211228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592628
6134	NC_008782	CAG	2	6	211254	211259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592628
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6136	NC_008782	GGC	3	9	211296	211304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592628
6137	NC_008782	GC	3	6	211314	211319	0 %	0 %	50 %	50 %	121592628
6138	NC_008782	GCC	2	6	211324	211329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592628
6139	NC_008782	TCG	2	6	211333	211338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592628
6140	NC_008782	CGCTG	2	10	211391	211400	0 %	20 %	40 %	40 %	121592628
6141	NC_008782	GCT	2	6	211403	211408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592628
6142	NC_008782	GCA	2	6	211418	211423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592628
6143	NC_008782	GCC	2	6	211424	211429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592628
6144	NC_008782	GAT	2	6	211431	211436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121592628
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6147	NC_008782	CGG	2	6	211514	211519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592628
6148	NC_008782	TCG	2	6	211528	211533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592628
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6150	NC_008782	GGCG	2	8	211546	211553	0 %	0 %	75 %	25 %	121592628
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6154	NC_008782	GCT	3	9	211703	211711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592628
6155	NC_008782	GCC	2	6	211723	211728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592628
6156	NC_008782	GGCGAA	2	12	211749	211760	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	121592628
6157	NC_008782	GCCA	2	8	211783	211790	25 %	0 %	25 %	50 %	121592628
6158	NC_008782	GGC	2	6	211805	211810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592628
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6183	NC_008782	CGGGT	2	10	212743	212752	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6184	NC_008782	AAC	2	6	212803	212808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121592630
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6190	NC_008782	CTG	2	6	213018	213023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592630
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6198	NC_008782	TGAC	2	8	213423	213430	25 %	25 %	25 %	25 %	121592630
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6202	NC_008782	GCAA	2	8	213780	213787	50 %	0 %	25 %	25 %	121592631
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6210	NC_008782	GCA	2	6	214072	214077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592631
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6225	NC_008782	ACA	2	6	214855	214860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121592632
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6228	NC_008782	GC	3	6	215037	215042	0 %	0 %	50 %	50 %	121592632
6229	NC_008782	GATG	2	8	215111	215118	25 %	25 %	50 %	0 %	121592632
6230	NC_008782	GAA	2	6	215318	215323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121592632
6231	NC_008782	CAGT	9	36	215340	215375	25 %	25 %	25 %	25 %	121592632
6232	NC_008782	AAGC	2	8	215402	215409	50 %	0 %	25 %	25 %	121592632
6233	NC_008782	CT	3	6	215429	215434	0 %	50 %	0 %	50 %	121592632
6234	NC_008782	CGCA	2	8	215471	215478	25 %	0 %	25 %	50 %	121592632
6235	NC_008782	CGG	2	6	215510	215515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592632
6236	NC_008782	CCGCA	2	10	215625	215634	20 %	0 %	20 %	60 %	121592632
6237	NC_008782	TTC	2	6	215770	215775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121592632
6238	NC_008782	GGAC	2	8	215848	215855	25 %	0 %	50 %	25 %	121592632
6239	NC_008782	TGA	3	9	215972	215980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121592632
6240	NC_008782	CGA	2	6	215994	215999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592633
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6242	NC_008782	CAG	2	6	216106	216111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592633
6243	NC_008782	AGC	2	6	216122	216127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592633
6244	NC_008782	CCG	2	6	216134	216139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592633
6245	NC_008782	CGG	2	6	216173	216178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592633
6246	NC_008782	GAC	2	6	216184	216189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592633
6247	NC_008782	GC	3	6	216216	216221	0 %	0 %	50 %	50 %	121592633
6248	NC_008782	GCAC	2	8	216332	216339	25 %	0 %	25 %	50 %	121592633
6249	NC_008782	GC	3	6	216357	216362	0 %	0 %	50 %	50 %	121592633
6250	NC_008782	TAC	2	6	216397	216402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592633
6251	NC_008782	GCCGC	2	10	216430	216439	0 %	0 %	40 %	60 %	121592633
6252	NC_008782	CAC	2	6	216480	216485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592633
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6254	NC_008782	GTGCTG	2	12	216520	216531	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	121592633
6255	NC_008782	CAGG	2	8	216633	216640	25 %	0 %	50 %	25 %	121592633
6256	NC_008782	GCA	2	6	216700	216705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592633
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6259	NC_008782	A	6	6	216838	216843	100 %	0 %	0 %	0 %	121592633
6260	NC_008782	GC	3	6	216894	216899	0 %	0 %	50 %	50 %	121592633
6261	NC_008782	CAC	2	6	216927	216932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592633
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6263	NC_008782	GC	3	6	217032	217037	0 %	0 %	50 %	50 %	121592633
6264	NC_008782	AGC	2	6	217041	217046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592633
6265	NC_008782	GCC	2	6	217051	217056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592633
6266	NC_008782	CAGC	2	8	217065	217072	25 %	0 %	25 %	50 %	121592633
6267	NC_008782	T	6	6	217183	217188	0 %	100 %	0 %	0 %	121592633
6268	NC_008782	CAT	2	6	217254	217259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592633
6269	NC_008782	GCT	2	6	217290	217295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592633
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6271	NC_008782	GCA	2	6	217353	217358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592633
6272	NC_008782	CTG	2	6	217408	217413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592633
6273	NC_008782	GCAG	2	8	217462	217469	25 %	0 %	50 %	25 %	121592633
6274	NC_008782	CGG	2	6	217472	217477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592633
6275	NC_008782	GGC	2	6	217488	217493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592633
6276	NC_008782	GCC	2	6	217497	217502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592633
6277	NC_008782	TGC	2	6	217607	217612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592633
6278	NC_008782	GGC	2	6	217644	217649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592633
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6280	NC_008782	CG	4	8	217754	217761	0 %	0 %	50 %	50 %	121592633
6281	NC_008782	TGG	2	6	217835	217840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592633
6282	NC_008782	GGC	2	6	217894	217899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592633
6283	NC_008782	GCT	2	6	217935	217940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592633
6284	NC_008782	GC	3	6	217942	217947	0 %	0 %	50 %	50 %	121592633
6285	NC_008782	GC	3	6	217958	217963	0 %	0 %	50 %	50 %	121592633
6286	NC_008782	GCC	2	6	218023	218028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592633
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6288	NC_008782	CAT	2	6	218079	218084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592633
6289	NC_008782	CAA	2	6	218085	218090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121592633
6290	NC_008782	GAG	2	6	218131	218136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121592633
6291	NC_008782	A	6	6	218152	218157	100 %	0 %	0 %	0 %	121592633
6292	NC_008782	CGG	2	6	218165	218170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592633
6293	NC_008782	TGACGG	2	12	218318	218329	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	121592633
6294	NC_008782	CTG	2	6	218353	218358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592633
6295	NC_008782	CGG	2	6	218396	218401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592633
6296	NC_008782	GCCA	2	8	218452	218459	25 %	0 %	25 %	50 %	121592633
6297	NC_008782	GTG	2	6	218494	218499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592633
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6299	NC_008782	CAG	3	9	218591	218599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592634
6300	NC_008782	CAG	2	6	218612	218617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592634
6301	NC_008782	CGA	2	6	218656	218661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592634
6302	NC_008782	GCCA	2	8	218679	218686	25 %	0 %	25 %	50 %	121592634
6303	NC_008782	CAG	2	6	218696	218701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592634
6304	NC_008782	CAT	2	6	218702	218707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592634
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6311	NC_008782	ATG	2	6	218973	218978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121592634
6312	NC_008782	CGG	2	6	218998	219003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592634
6313	NC_008782	ATG	2	6	219051	219056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121592634
6314	NC_008782	GCC	2	6	219108	219113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592634
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6316	NC_008782	CCA	2	6	219151	219156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592634
6317	NC_008782	CCGCG	2	10	219157	219166	0 %	0 %	40 %	60 %	121592634
6318	NC_008782	GC	3	6	219185	219190	0 %	0 %	50 %	50 %	121592634
6319	NC_008782	GC	3	6	219203	219208	0 %	0 %	50 %	50 %	121592634
6320	NC_008782	CAG	2	6	219233	219238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592634
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6324	NC_008782	CG	3	6	219336	219341	0 %	0 %	50 %	50 %	121592634
6325	NC_008782	CCAC	2	8	219343	219350	25 %	0 %	0 %	75 %	121592634
6326	NC_008782	GGC	2	6	219404	219409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592634
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6328	NC_008782	GCCGA	2	10	219477	219486	20 %	0 %	40 %	40 %	121592634
6329	NC_008782	CCA	2	6	219490	219495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592634
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6331	NC_008782	CG	3	6	219529	219534	0 %	0 %	50 %	50 %	121592634
6332	NC_008782	CCA	2	6	219553	219558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592634
6333	NC_008782	CAG	3	9	219584	219592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592634
6334	NC_008782	CAGC	2	8	219611	219618	25 %	0 %	25 %	50 %	121592634
6335	NC_008782	CCA	2	6	219646	219651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592634
6336	NC_008782	GCG	2	6	219652	219657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592634
6337	NC_008782	CCCA	2	8	219687	219694	25 %	0 %	0 %	75 %	121592634
6338	NC_008782	TGG	2	6	219709	219714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592634
6339	NC_008782	CAG	3	9	219764	219772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592634
6340	NC_008782	GCG	2	6	219854	219859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592634
6341	NC_008782	GGC	3	9	219860	219868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592634
6342	NC_008782	GGC	2	6	219885	219890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592634
6343	NC_008782	GCG	2	6	219930	219935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6344	NC_008782	TGC	2	6	219976	219981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592635
6345	NC_008782	TGG	2	6	220007	220012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592635
6346	NC_008782	GGCC	2	8	220085	220092	0 %	0 %	50 %	50 %	121592635
6347	NC_008782	GCC	2	6	220095	220100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592635
6348	NC_008782	TGG	2	6	220123	220128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592635
6349	NC_008782	GCCC	2	8	220158	220165	0 %	0 %	25 %	75 %	121592635
6350	NC_008782	TG	3	6	220215	220220	0 %	50 %	50 %	0 %	121592635
6351	NC_008782	CGC	2	6	220221	220226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592635
6352	NC_008782	CGG	2	6	220240	220245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592635
6353	NC_008782	CGG	2	6	220265	220270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592635
6354	NC_008782	CG	3	6	220277	220282	0 %	0 %	50 %	50 %	121592635
6355	NC_008782	GCT	3	9	220289	220297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592635
6356	NC_008782	CG	3	6	220306	220311	0 %	0 %	50 %	50 %	121592635
6357	NC_008782	GC	3	6	220317	220322	0 %	0 %	50 %	50 %	121592635
6358	NC_008782	GCC	2	6	220338	220343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592635
6359	NC_008782	TG	3	6	220345	220350	0 %	50 %	50 %	0 %	121592635
6360	NC_008782	CCG	2	6	220351	220356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592635
6361	NC_008782	CCGC	2	8	220387	220394	0 %	0 %	25 %	75 %	121592635
6362	NC_008782	GCGCG	2	10	220417	220426	0 %	0 %	60 %	40 %	121592635
6363	NC_008782	CG	3	6	220433	220438	0 %	0 %	50 %	50 %	121592635
6364	NC_008782	GCT	2	6	220439	220444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592635
6365	NC_008782	CAG	2	6	220467	220472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592635
6366	NC_008782	GC	4	8	220478	220485	0 %	0 %	50 %	50 %	121592635
6367	NC_008782	GGC	2	6	220486	220491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592635
6368	NC_008782	GC	3	6	220505	220510	0 %	0 %	50 %	50 %	121592635
6369	NC_008782	CTGCG	2	10	220545	220554	0 %	20 %	40 %	40 %	121592635
6370	NC_008782	AGCGCC	2	12	220563	220574	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	121592635
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6375	NC_008782	GC	3	6	220692	220697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6377	NC_008782	GCG	2	6	220729	220734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6430	NC_008782	CG	3	6	222166	222171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6431	NC_008782	CTG	2	6	222180	222185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6490	NC_008782	GTC	2	6	224205	224210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592640
6491	NC_008782	CGC	2	6	224228	224233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592640
6492	NC_008782	GCG	2	6	224338	224343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592640
6493	NC_008782	GCA	2	6	224351	224356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592640
6494	NC_008782	CAG	2	6	224367	224372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592640
6495	NC_008782	GTC	2	6	224379	224384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592640
6496	NC_008782	CG	3	6	224385	224390	0 %	0 %	50 %	50 %	121592640
6497	NC_008782	CTT	2	6	224459	224464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121592640
6498	NC_008782	TGG	2	6	224489	224494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592640
6499	NC_008782	GCC	2	6	224532	224537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592640
6500	NC_008782	CTG	2	6	224556	224561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592640

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